Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms