Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG3Q9UJ98 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG3Q9UJ98 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG3Q9UJ98 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG3Q9UJ98 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
STAG3Q9UJ98 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STAG3Q9UJ98 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms