Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CYTH4Q9UIA0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CYTH4Q9UIA0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms