Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR5

CKLF, Chemokine-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKLFQ9UBR5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CKLFQ9UBR5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms