Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CNTLNQ9NXG0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTLNQ9NXG0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTLNQ9NXG0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTLNQ9NXG0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTLNQ9NXG0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTLNQ9NXG0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTLNQ9NXG0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTLNQ9NXG0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTLNQ9NXG0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTLNQ9NXG0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTLNQ9NXG0 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms