Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHBDL2Q9NX52 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms