Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWY4

HPF1, Histone PARylation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPF1Q9NWY4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPF1Q9NWY4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms