Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATAD3AQ9NVI7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms