Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SERINC1Q9NRX5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms