Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8S5

CNTD2, Cyclin N-terminal domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD2Q9H8S5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTD2Q9H8S5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms