Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCGF6Q9BYE7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCGF6Q9BYE7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms