Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MAP1LC3CQ9BXW4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms