Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
HIGD2AQ9BW72 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms