Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2AFJQ9BTM1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms