Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms