Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARXQ96QS3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARXQ96QS3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms