Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRAPPC9Q96Q05 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms