Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM227BQ96M60 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms