Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNBD2Q96M20 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms