Protein–RNA interactions for Protein: Q96GZ6

SLC41A3, Solute carrier family 41 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A3Q96GZ6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC41A3Q96GZ6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC41A3Q96GZ6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms