Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF428Q96B54 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF428Q96B54 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms