Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOBEC4Q8WW27 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms