Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC12Q8WUD4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms