Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms