Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZIC4Q8N9L1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms