Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NPAS3Q8IXF0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms