Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LMBR1LQ6UX01 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms