Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A10Q6U841 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms