Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1S2

C3orf33, Protein C3orf33, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf33Q6P1S2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C3orf33Q6P1S2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms