Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VIRMAQ69YN4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms