Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PHYHD1Q5SRE7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms