Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HSD17B12Q53GQ0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms