Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC57Q2TAC2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms