Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NTRK3Q16288 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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