Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GRIK4Q16099 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GRIK4Q16099 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms