Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP6AP1Q15904 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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