Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USF2Q15853 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
USF2Q15853 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
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