Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIP4Q15650 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP4Q15650 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP4Q15650 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP4Q15650 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP4Q15650 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP4Q15650 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP4Q15650 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP4Q15650 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP4Q15650 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP4Q15650 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP4Q15650 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP4Q15650 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP4Q15650 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP4Q15650 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP4Q15650 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP4Q15650 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIP4Q15650 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
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