Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SIX1Q15475 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SIX1Q15475 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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