Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms