Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HNF4GQ14541 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms