Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERV3-1Q14264 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERV3-1Q14264 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms