Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CACNA1SQ13698 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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