Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SGCGQ13326 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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