Protein–RNA interactions for Protein: Q10472

GALNT1, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT1Q10472 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GALNT1Q10472 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GALNT1Q10472 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms