Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IRF8Q02556 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF8Q02556 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms