Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DSG1Q02413 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DSG1Q02413 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms