Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACTA1P68133 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms