Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB15P59190 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB15P59190 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB15P59190 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB15P59190 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB15P59190 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB15P59190 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB15P59190 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB15P59190 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB15P59190 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB15P59190 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB15P59190 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB15P59190 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB15P59190 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB15P59190 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB15P59190 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB15P59190 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB15P59190 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB15P59190 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB15P59190 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB15P59190 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB15P59190 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB15P59190 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB15P59190 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB15P59190 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB15P59190 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB15P59190 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB15P59190 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB15P59190 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB15P59190 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB15P59190 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB15P59190 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms