Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AFDNP55196 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AFDNP55196 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AFDNP55196 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AFDNP55196 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AFDNP55196 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AFDNP55196 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AFDNP55196 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AFDNP55196 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AFDNP55196 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFDNP55196 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFDNP55196 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFDNP55196 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFDNP55196 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AFDNP55196 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFDNP55196 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFDNP55196 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFDNP55196 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFDNP55196 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFDNP55196 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFDNP55196 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AFDNP55196 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AFDNP55196 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AFDNP55196 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms